麟德元年(664年)，上官仪因替高宗起草将废武则天的诏书，与父亲上官廷芝一起被武则天所杀，刚刚出生的上官婉儿与母亲郑氏同被配没掖廷。在掖廷为奴期间，在其母的精心培养下，上官婉儿熟读诗书，不仅能吟诗着文，而且明达吏事，聪敏异常。

仪凤二年(677年)，武则天召见了年仅十四岁的上官婉儿，当场出题考较。上官婉儿文不加点，须臾而成，且文意通畅，词藻华丽，语言优美，真好像是夙构而成。 武则天看后大悦，当即下令免其奴婢身份，让其掌管宫中诏命。

神龙元年(705年)，张柬之等拥护李唐宗室的大臣发动神龙政变，武则天被迫退位。神龙政变后，唐中宗复辟，又令上官婉儿专掌起草诏令，深被信任，又拜为昭容，封其母郑氏为沛国夫人。

六月，李显突然驾崩，韦皇后将台阁政职、内外兵马大权以及中央禁军等全部安排了自己的党羽和族人，朝政大权尽落韦氏之手。上官婉儿与太平公主起草了一份遗诏，立李重茂为皇太子，李旦辅政，韦皇后为皇太后摄政，以平衡各方势力，然而宰相宗楚客、韦温更改诏书，劝韦后效仿武则天。

得到消息的临淄王李隆基与太平公主商议，决定先下手为强，7月21日李隆基发动唐隆之变，以禁军官兵攻入宫中，杀上官婉儿于旗下，而后杀死韦后、安乐公主及所有韦后一党，拥立其父李旦。